谢邀，乡镇一级的机构改革其实是基本完成的，在2018机构改革中，应是整合并对应上级部门进行设定，乡镇畜牧兽医站将如何改。在新一轮党政机构改革中，以及事业单位分类改革中的“承担行政职能的事业单位改革方案”中，明确规定撤销原畜牧兽医局，将其承担的动物诊疗机构许可、职业兽医注册备案、兽药经营许可等行政职能划入新组建的农业农村局。
1、市县的畜牧局会怎么改革？
市县畜牧兽医局是2005年国家要求进行兽医体制改革后设立的，国家和省级分别设立的兽医局，农业部下属的兽医局的单位的性质是行政编制，而省级的单位性质有些是行政编制，有些是参公编制。而市县级改革则是一种“换汤不换药”式的改革，将以前的畜牧技术服务中心、畜牧兽医站改成了畜牧兽医局，仅仅是变了一下名字，其管理模式和管理权限都没有改变，
由于市县畜牧兽医局的存在不符合现代化的农业管理模式，所以这次机构改革中其行政权力全部被剥离到农业农村局，仅留下了畜牧兽医方面的技术服务功能，变成了一个单纯的事业单位。市县级畜牧兽医局如何改革，可能各地区的情况都不相同，以我们甘肃为例来说，有些市依旧保留了畜牧兽医局，比如说天水定西，他们将畜牧兽医局升格为市政府直属行政局，与农业农村局并列，
而他们下属区县的畜牧兽医局，一般都改成了畜牧兽医技术服务中心或类似机构，变成了纯事业单位。而另外一些市，他们是将畜牧兽医局改成了畜牧兽医服务中心，变成了纯粹的事业单位，而下属的区县变成了纯粹的畜牧兽医站，像陇南市的畜牧兽医局则是变成了畜牧兽医站，这样下属的区县也就只能变成了畜牧兽医站。只是有个特例就是好多畜牧兽医局以前是参公管理的，尤其是市级畜牧兽医局大多数都是参公单位，个别县级畜牧兽医局也是属于参公单位，按照改革前后不改变个人待遇的规定，他们依旧按照参公单位管理，只是将来参公单位如果取消的话，这部分的人的身份只能慢慢消化，
在各种行政职能上来说名义上行政职能都上交农业农村局，可是仅畜牧兽医方面的行政职能就很多，像种畜禽管理、重大动物疫病防治、动物检疫等等有十六七项之多，而农业农村局一般行政编制也就十几人或者二十多人，完全不能承担，而且大多数都是技术职能，需要专业技术，因此一般来说还得农业农村局委托畜牧兽医站的基层技术人员来操作，因此上也是属于“换汤不换药”，将来怎么样，还得理顺其关系。
2、基层畜牧兽医站怎么改革？
畜牧兽医站是乡镇七站八所之一，过去主要是负责给乡镇各村屯的家畜防疫检验、诊疗阉割等事项，随着时代的发展，其工作职责发生了根本性变化，已由过去单一的防疫诊疗拓展为融合动物及动物产品的检验检疫、畜牧产品安全、兽医兽药、动物饲料及添加剂等与畜牧兽医相关的产品服务与监管于一体的职能体系。其机构性质也由过去的全民所有制机构，发展为国家机构编制部门认定的事业单位（1996年开展三定），少部分参公，绝大多数都列入公益一类事业范畴，由财政全额拨款供养，
管理方式实行条块结合的双重领导，人财物接受上级农业农村局管理（原畜牧兽医局在2018年党政机构改革中已并入农业农村局），行政事务接受乡镇管理。有部分地区已下沉职能将畜牧兽医站划入乡镇机构管理范畴，农业农村局只负责业务指导，从职责来看，乡镇畜牧兽医站除了动物防疫等服务职责外，有一个很重要的任务就是对乡镇畜牧兽医及其衍生产品的监管，具有一定的行政执法职责，按照机构改革的要求，应该列入参公管理的范畴。
但实际上受乡镇机构和编制的限制，多数乡镇畜牧兽医站都没有参公，而是作为公益一类事业单位行使行政管理及执法职责，存在明显的混编混岗现象，因此长期以来都有将乡镇畜牧兽医站参公的呼声，至今都没有实现，目前，随着乡镇机构改革的推进，不少地区的乡镇畜牧兽医站已经被列入改革目录，将其职能一分为二，一部分职责主要是指动物防疫监管职责划入乡镇综合执法大队，人员和编制随职能转隶，实行综合执法；其余职责全部并入乡镇新成立的农业农村服务中心，从事公益服务职责，不再保留畜牧兽医站单独机构设置。
