菌种鉴定的方法一般有常规鉴定和分子生物学方法：（1）常规鉴定：菌落形态观察、革兰氏染色、菌毛染色、糖类分解实验、吲哚实验、淀粉水解实验、V-P实验、甲基红实验、柠檬酸盐利用实验、硝酸盐还原实验、接触酶实验等（2）分子生物学方法：细菌16SrDNA菌种鉴定：提取DNA，特定引物PCR扩增，PCR产物纯化测序，进化树分析；真菌18SrDNA/ITS菌种鉴定流程也是一样的菌种种类有那些,二、液体菌种母种→摇瓶菌种→发酵罐菌种1、母种液体菌种的母种和固体菌种的母种制作工艺相同2、摇瓶菌种摇瓶菌种：是指用三角瓶做容器，接种后在摇床上培养的菌种，摇床分为旋转式摇床和往复式摇床,3、发酵罐菌种发酵罐菌种：是指用专用的食用菌液体菌种发酵罐培养的液体菌种。
二、液体菌种母种→摇瓶菌种→发酵罐菌种1、母种液体菌种的母种和固体菌种的母种制作工艺相同2、摇瓶菌种摇瓶菌种：是指用三角瓶做容器，接种后在摇床上培养的菌种，摇床分为旋转式摇床和往复式摇床。三角瓶有直口和斜口两种，我们通常使用直口三角瓶。摇瓶菌种的培养时间是5-10天。3、发酵罐菌种发酵罐菌种：是指用专用的食用菌液体菌种发酵罐培养的液体菌种。发酵罐菌种的培养时间是5-10天
首先你要确定待鉴定的菌种一定是纯种。如果菌种不纯，所观察到的现象则是混合现象，这样自然不会得到正确的结果。因此在鉴定之前，首先要将菌种纯化。纯化方法，一般有2种：平板划线单菌落分离法和单细胞分离法。前一种操作简便，效果良好，适用范围广。菌种鉴定的方法一般有常规鉴定和分子生物学方法：（1）常规鉴定：菌落形态观察、革兰氏染色、菌毛染色、糖类分解实验、吲哚实验、淀粉水解实验、V-P实验、甲基红实验、柠檬酸盐利用实验、硝酸盐还原实验、接触酶实验等（2）分子生物学方法：细菌16SrDNA菌种鉴定：提取DNA，特定引物PCR扩增，PCR产物纯化测序，进化树分析；真菌18SrDNA/ITS菌种鉴定流程也是一样的
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