所以运行qPCR后,除了Ct值,其他数据在后续的分析计算中几乎没有用,模板的Ct值与模板的初始拷贝数的对数有一定的线性关系,勇往直前数据分析,首先对数据进行规划,拟定数据来源和采集工具;然后通过采集平台对数据进行采集和处理,可以生成明确的报表或者录入数据库,数据分析流程使用数据分析工具连接到数据进行数据探索。
qPCR的数据处理方法是△△Ct法,其特点是仅依靠Ct值计算结果。所以运行qPCR后,除了Ct值,其他数据在后续的分析计算中几乎没有用。但前提是目标基因和内参基因的扩增效率要基本相同。1.我们先来了解一下什么是Ct值?Thresholdcycle也写作Cq值,荧光信号达到荧光阈值时的PCR循环次数。仪器软件通常将第3-15个周期的荧光值设置为基线。阈值通常是基线标准偏差的10倍。模板的Ct值与模板的初始拷贝数的对数有一定的线性关系。模板的初始浓度越高,Ct值越小。初始模板剂量浓度越低,Ct值越大。当PCR的循环达到Ct值的循环数时,才刚刚进入真正的指数扩增期(对数期)。此时轻微的误差还没有被放大,Ct值的重现性较好,即相同含量的初始值为模板,得到的Ct值比较稳定。
勇往直前数据分析,首先对数据进行规划,拟定数据来源和采集工具;然后通过采集平台对数据进行采集和处理,可以生成明确的报表或者录入数据库。数据分析流程使用数据分析工具连接到数据进行数据探索。这里可以使用excel或者一些BI工具。目前国内有很多自主研发的BI工具非常好用,比如我们公司正在使用的DataFocus,非常方便;最后把需求和市场结合起来,生成一个完整的数据分析 report文档,也可以利用DataFocus的广告牌,直接整合成一个漂亮的大屏,直接向领导或客户演示。
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