它具有肝毒性作用，并引起肝细胞脂肪浸润和肝肿大,可以加强放疗造成的组织损伤,②静脉静脉注射可引起静脉炎，血管渗漏可引起疼痛、局部硬结、溃烂；③脱发；④具有免疫抑制作用；⑤可对孕妇造成致畸；⑥长期应用可抑制睾丸或卵巢功能，引起闭经或精子缺乏,放线菌蛋白D能与DNA双螺旋结合产生细胞毒性。
①可引起白细胞减少、血小板减少、厌食、恶心呕吐等。②静脉静脉注射可引起静脉炎，血管渗漏可引起疼痛、局部硬结、溃烂；③脱发；④具有免疫抑制作用；⑤可对孕妇造成致畸；⑥长期应用可抑制睾丸或卵巢功能，引起闭经或精子缺乏。胃肠道反应、恶心、呕吐、食欲不振、腹胀、腹泻、少数口腔溃疡、骨髓抑制、白细胞减少和低血容量、脱发、皮炎、药物热。可以加强放疗造成的组织损伤。它具有肝毒性作用，并引起肝细胞脂肪浸润和肝肿大。
放线菌蛋白D能与DNA双螺旋结合产生细胞毒性。与脱氧鸟苷的结晶复合物的调制衍射研究表明，该产物的吩噁嗪环平面可嵌入DNA中鸟苷和胞苷的碱基对之间，其肽链沿螺旋槽延伸。这样，该产物与DNA形成的复合物非常稳定，RNA聚合酶对DNA的转录因此被阻断。依赖DNA的RNA聚合酶比DNA聚合酶对该产物的作用更敏感。此外，该产物还会导致DNA单链断裂，这可能是由自由基介导的，也可能是通过TopbI的作用。
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