企业作为扣缴义务人，每月给员工工资，薪金所得进行个人所得税的纳税申报。专项附加扣除两种申报方式，或年终奖的两种申报方式，点击右上角“发送申报”，然后等税务局的反馈信息，反馈信息看“申报状态”，如果成功会显示“成功申报无须缴款”或“成功申报，需要缴款”若需要缴款，则返回主页左边菜单栏位，找到“税款缴纳”，点击“税款缴纳”进去缴纳税款。
1、企业如何申报个人所得税？
如果是公司制企业，那么，企业要给员工代收代缴个人所得税。步骤如下：第一步，给新员工做信息采集，登录自然人电子税务局客户端，双击APP，双击APP以后，跳出以下登录界面：点击申报密码登录，输入公司名称，公司统一信用代码（也就是纳税人识别号），以及申报密码。然后点击登录，进入以下界面：点击“人员信息采集”，进入以下界面：若是单个添加的话，首先点击“境内人员”或“境外人员”，然后再点击“添加”，进入以下界面：填写新员工信息，带“*”为必填项，
填写好以后，点击“保存”接下来，勾选新采集好的员工信息，点击“报送”菜单，等待税务局的反馈信息。如果新增员工的信息“报送”以后，身份验证状态为“验证通过”，则说明，新员工信息采集成功，若身份验证状态为“不通过”，那么就要去检查哪些信息没有填写，或者填写信息不符合要求，去修改好以后，再点击保存，然后，再次勾选新员工信息，点击“报送”，再次等待税务局的信息反馈。
一直到“验证通过”为止，第二大步骤：企业作为扣缴义务人，每月给员工工资，薪金所得进行个人所得税的纳税申报。通过自然人电子税务局客户端输入公司名称，纳税人识别号，以及个税申报密码以后，进入纳税申报系统首页，左侧是代扣代缴菜单，请看下图：员工工资，薪金所得是属于综合所得申报，所以，点击菜单“综合所得申报”，进去进行纳税申报表的填写！进入界面，如下图：点击“正常工资，薪金所得”，进去填写纳税申报表，
纳税申报表填写完以后，继续第2步，税款计算。计算好税款以后，第3步，附表填写，如果附表没有要填写的内容，那么可以直接跳过，或者点开保存。然后就是第4步，“申报表报送”，点击完“申报表报送”以后，进入以下界面，如下图：点击右上角“发送申报”，然后等税务局的反馈信息，反馈信息看“申报状态”，如果成功会显示“成功申报无须缴款”或“成功申报，需要缴款”若需要缴款，则返回主页左边菜单栏位，找到“税款缴纳”，点击“税款缴纳”进去缴纳税款。
若是签订了三方协议（公司，银行，税务局签订三方协议），那么点击“三方协议缴税”进去，点击“三方协议缴税”进去以后，点击“立即缴款”，税款则会自动从公司公账上扣除！如果是非公司制企业，比如个体工商户，个人独资企业，合伙企业的经营所得交的是个人所得税，不是企业所得税。填写的纳税申报表又是不一样的，这里由于文章篇幅问题，不再详细讲解。
2、个人所得税申报有两种方式，如何选择才能更适合自己呢？
这个问题有歧义，提问者可能要问的是：专项附加扣除两种申报方式，或年终奖的两种申报方式，一，专项附加扣除的两种申报方式：1、个人报送：个人次年3-6月做个人所得税汇算清缴，增加专项附加扣除额，申请退税。优点：无信息泄露风险；缺点：需要申请退税，占用资金时间长，2、单位统一报送：专项附加扣除信息发送单位，由单位按月预扣款时扣除（申报方式有：纸质采集表，电子采集表，手机APP）。
这样每月个税金额减少，到手金额增加，优点：手续简单，占用资金时间短；缺点：纸质和电子采集表会泄露个人相关信息(手机APP能有效减少泄露风险，单位能接收到的敏感信息都会加密）二，年终奖的两种申报方式（2019.1.1-2021.12.31）单独计算与合并到当年综合所得计算：1、对于低收入者，适用合并当年综合所得计算；2、对于年终奖特高者，也适用合并当年综合所得计算；3、对于中等收入者，适用单独计算；举例1：某人每月收入8000元，四金1400元，专项附加扣除2000元，年终奖3万元；8000-1400-2000-5000
