虽然南京六部的权力远不如北京六部，但是南京六部也有一定职权。同京师六部一样，南京六部官员也要日常坐班，六部衙门也有人轮流值班，衙门负责人需要定期向北京述职，至于上朝，不是有品级的京官肯定不用上朝的，南京兵部要负责南京地区的守备，南京地区的49个卫所，都隶属于南京兵部尚书指挥，而南京吏部负责南京官员六年一度的京察考功，这个事情北京吏部是不能干涉的，而南京刑部负责南京诸司、公侯伯府、京卫所的刑名；而南京工部的执掌跟北京工部差不多，只是管辖的区域限于南京及南直隶地区而已，至于南京礼部确实没有什么事情可以做，毕竟，皇帝又不来南京，一年到头没有什么礼仪祭祀活动。
1、明朝南京六部和北京六部，权力相差多大？
南京六部管辖南直隶和南方诸省事务，北京六部管辖直隶和北方诸省事务。如南京户部就负责南直隶和浙江、江西、湖广等省税粮以及漕运、盐引勘合等等，其分量远远超过北京户部；南京吏部负责南方官员的京察考功，北京吏部不得干涉，南方地区守备归南京兵部尚书管理指挥，北京兵部调不动南方军队；南京六部里只有礼部职责比较小，因为南京不再举行会试，但南京乡试的规模是北直隶乡试的10倍以上，自正统年后，南京礼部也不负责皇帝登基、葬礼、祭祀活动，
2、都知道明朝在南京有六部，南明时候为何感觉不作为？
这种情况并不奇怪！因为自从朱棣发动“靖难之变”，夺了侄儿建文帝朱允炆的皇位之后，因恐饶治不稳，遂将都城由南京迁到了北京。从这以后，虽然明朝仍将南京做为留都对待，而且还保留了中央六部等一整套政府机关，当做备分，然而在实际权力上，南京是难以和北京相比的！因此南京的政府机关与北京相比，只是徒有其表而已。并且在明朝中期以后，还成了朝廷安置遭受排挤官员的所在，
因此尽管明朝有南北两京，但是南京的存在感一直是比较低的！这就是为什么北京被李自成攻破后，南京无法立即充分发挥出留都作用的原因之一。此外在南明弘光政权执政之时，由于没有来得及做好内部整合，也没有及时制定出符合实际需要的政策，再有南明弘光政权君主昏庸，大臣之间又争权夺力，领兵大将之间又积不相能，所以才会浪费了重整旗鼓的大好机会，故而尽管南京在手，他们也无法充分加以利用！更别说让他们打过长江去，恢复大中原了！况且清军也没有给南明留下加以整合的时间，在1644年打破李自成夺取北京之后，清军立即分兵扫荡大顺、大西这两个北方政权，同时又兵贵神速的向弘光政权发动了攻击！随着史可法战死扬州，弘光政权的防御被粉碎了，南京城也暴露在清军的兵锋之下！最后南京城被清军破，弘光政权随之也就垮台了！而在此之后，就再也没有一支南明抗清力量，可以重新夺回南京城了！综上所述:除了明初二帝在南京有所作为，之后随着明成祖迁都北京，南京便被边缘化了！而到了南明弘光政权占据南京之时，本应有所作为，但却没有作为！所以当南京在他们手上丟失之后，就再也无法发挥其留都的作用了。
3、明朝的南京官员权利很小吗？为什么？
明朝的两京制与历史上的两京、多京制比较，最大的不同就是在留都也设有一套完整的中央机构，正统六年（1441）年，两京制正式定型。南京所设立的机构近乎与北京对称，也有五府、六部、九卿等衙门，品级与北京也完全相同，南京也有自己的特点，某些地方不同于北京。我来简单聊一聊，南京远离天子，政权的核心是亲臣和重臣。
南京守备厅会议是南京的最高权力所在，南京守备、参赞是守备厅的常务官，《明史.职官志》说：“南京以守备及参赞机务为要职。”景泰三年（1452）设协同守备一人，多以侯、伯、都督充任，南京半壁江山的事务全交给几个公、侯、伯掌管，皇帝不是很放心，于是在设立南京守备之后，洪熙元年（1425）又命内官监太监郑和以下西洋官军守备南京。
初设守备太监一人，以后增为二人，一正一副，皇帝不在南京，南京就不设内阁了。表面上看，南京守备和南京守备太监是平行的，不相统属，但南京守备太监是“司礼监外差”，天子“三千里外亲臣”，所以守备虽以公、侯、伯之尊，也要屈尊俯首，南京守备厅会议议事时，太监通常“据首席”，目的是保障南京权力核心与整个国家的核心——皇帝保持高度一致。
